微生物肥料在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中起著重要的作用，不僅體現(xiàn)在改善土壤養(yǎng)分供應(yīng)，還體現(xiàn)在促進作物生長、抗病、抗逆性、提高產(chǎn)量、提高質(zhì)量等方面（以微生物菌劑為例）。

1、改善土壤養(yǎng)分供應(yīng)：微生物肥料主要通過各種細菌促進土壤中不溶性養(yǎng)分的溶解和釋放。同時，由于細菌代謝釋放大量無機有機酸，促進土壤微量元素硅、鋁、鐵、鎂、鉬釋放和螯合，有效打破土壤硬化，促進顆粒結(jié)構(gòu)的形成，使土壤固定無效肥料進入有效肥料，改善土壤養(yǎng)分供應(yīng)、通風和松散。

2.促進作物生長：微生物肥料的使用促進了刺激素，即植物生長調(diào)節(jié)劑的產(chǎn)生、調(diào)節(jié)和作物的生長發(fā)育。使用微生物菌劑可促進赤霉素、生長素等活性物質(zhì)的產(chǎn)生。

3.增強作物抗病性和抗逆性：微生物肥料中的一些細菌具有分泌抗菌素和多種活性酶的功能，抑制或殺死致病真菌和細菌；同時，大量的田間試驗也證明，微生物肥料的應(yīng)用可以降低病蟲害的發(fā)生率，提高作物的抗逆性。對棉花黃枯萎病、稻瘟病、小麥白粉病、莖腐病、蔬菜猝倒病、立枯病、青枯病等有一定的防治抑制作用。大量實驗表明，地恩地微生物菌劑能有效抑制某些類型的線蟲病的發(fā)生。同時，它還具有明顯的抗旱、抗寒、抗倒伏、抗鹽堿作用，提高作物的抗病性，有效預(yù)防作物生理病害的發(fā)生。

4.提高產(chǎn)量和質(zhì)量:微生物肥料的使用可以提高農(nóng)產(chǎn)品中維生素C、氨基酸和糖的含量，有效降低硝酸鹽的含量，使生產(chǎn)出來的農(nóng)產(chǎn)品美味美觀，以良好的價格出售。作物產(chǎn)量可以增加20-30%。